В компании считают, что топ-менеджер совершал растраты, а также допускал самоуправство и злоупотреблял доверием. В частности, его подозревают в размывании доли предприятия во «Владимиртеплогазе», а также обвиняют в переводе последнего под управление компании «МРГ-Инвест», которой руководит Александр Филиппов.
«Владимиртеплогаз» занимается снабжением потребителей области тепловой энергией и горячей водой. В роли собственников предприятия выступают компании «Газпром межрегионгаз Владимир» и «Энергосервис» (42,71% и 57,29% соответственно). «Энергосервисом» управляет «МРГ-Инвест». В марте 2013 года акционеры «Владимиртеплогаза» приняли решение о наращивании капитала предприятия на 10 млн рублей, внесенных «Энергосервисом».
После инвестирования средств доля «Энергосервиса» выросла с 49% до 57,29%. Таким образом, предприятие Филиппова стало контролировать теплоснабжающую компанию. Впоследствии новое руководство подразделения «Газпрома» попыталось опротестовать потерю контроля над подразделением, крупно задолжавшего компании. В частности, ГМВ пытается оспорить законность голосования акционеров «Владимиртеплогаза».
По словам губернатора Владимирской области Светланы Орловой, обвинения по отношению к Сергею Филиппову не имеют под собой политической составляющей, а являются результатом спора двух объектов хозяйствования. Губернатор отдельно подчеркнула, что Филиппов-младший не был ее соперником. Он выдвигался на должность губернатора от «Гражданской платформы», однако не смог преодолеть муниципальный фильтр.